现有的认识论基础脆弱，体系不全，导致人们对科学失去信心。我们需要一个系统的、完整的认识论。太极进化主义的本体论和认识论的基本原则都是实用主义与理性（理想）主义的统一，是唯物主义与唯心主义的统一，是形而上学与辩证法的统一，是决定论和自由意志的统一。

太极进化主义的认识论叫做实践经验主义认识论，它是彻底的唯名论和彻底的经验主义，同时对传统的经验主义作了很多改造。“经验主义”之前加“实践”二字，有两个含义：第一，表明认识来自实践，不是纯粹的主观臆测，具有异己性；第二，表明认识为实践服务，真理的根本标准是实用，而不是与客观世界相同。

实践经验主义认识论首先研究智能的起源，从系统的刺激反应开始，然后考察柔性的特点，再从一般系统的柔性到生物的柔性，从生物的柔性到条件反射，最后从条件反射中找出人类认识的本质，并依据这个本质建立太极进化主义的认识论。

实践经验主义认识论的内容主要包括四个部分，借用佛教术语简称为：受、想、行、识。受在这里指感受、经验；想指抽象、演绎、分析、还原、创意、建构等思想过程；行指来自实践和经验的客观性、偶然性和必然性；识指真理和系统化的理论体系。