唯物主义认为意识是物质的一部分。如果科学能够完全了解大脑的工作过程，就可以把大脑当成一部机器，用大脑的运动过程来表示意识。但是因为大脑太复杂，只能当成黑箱。黑箱的研究方法是观察输入与输出，然后建立模型实现同样的输出。大脑的输出有两种内容：行为和意识，观察意识的内容对建立模型很重要。通过运用黑箱的方法，人们已经对大脑的运动规律有了一些了解，建立了一些模型，并得到广泛应用，组织行为学和心理学等都是这种模型的建立和应用。但是现有的模型还太粗糙，模型的输出与实际大脑的输出相差太远。所以不能把大脑当成机器，必须承认它的自主性。

  詹奇说：“最简单的自维生系统例如化学耗散结构也有某种意识原型。”这样说不能算错，但是没有意义，而且容易引起误解。我们承认大脑的自主性是不得已的，承认这种自主性就意味着我们无法预测他的输出，不能预测就难以应对，就会损害人的利益。对于最简单的自维生（自组织）系统我们完全有能力预测它们的输出，因此没有任何必要承认它们的自主性，不能当成意识。

  在古代人看来，风雨雷电、日月星辰都有自主性，随着科学发展，人们认识的自然规律增多了，这些事物的自主性就都消失了。在人的认识和实践的客体当中，自主性越少越好，承认简单系统的自主性完全是一种倒退。瓦尔纳把耗散系统的分岔称为决策（埃里克·詹奇,自组织的宇宙观[M].曾国屏等译.中国社会科学出版社,1992:48,56.），这种说法也不对。决策意味着决策的主体有自主性，但是耗散结构的分岔取决于边界条件，不是由系统自己决定的，不存在自主性，所以不存在决策。